Program obveznih cijepljenja donosi za tekuću godinu Ministar nadležan za zdravstvo temeljem Zakona o zaštiti pučanstva od zaraznih bolesti i pratećih pravilnika. Cijepljenje je najučinkovitija medicinska intervencija 20. stoljeća. Ovim postupkom umjetnog stvaranja zaštite od infektivnih bolesti se kod cijepljenika stvara imunosna memorija s krajnjim ciljem eliminacije uzročnika.

Program mandatornog cijepljenja za tekuću 2007. godinu je protiv: difterije, tetanusa, hripavca, dječje paralize, ospica, zaušnjaka, rubeole, tuberkuloze, hepatitisa B i bolesti izazvanih s Haemophilus influenzae tipa b (Hib) prema dobnoj obvezi. Ne brojeći tri cijepljenja per os sa živim polio cjepivom, dojenče i dijete do 1,5 godine u Hrvatskoj prima razna kombinirana i pojedinačna cjepiva u obliku injekcija čak 14 puta što je  vrlo brojno i komplicirano.

Ocjena vrijednosti cjepiva donosi se uzimajući u obzir: zaštitnu vrijednost cjepiva, korisnost primjene, neškodljivost, jednostavnost primjene i trajnost zaštite  postignute cijepljenjem.

Učinkovitost cijepljenja  ocjenjuje se  temeljem praćenja pobola od bolesti protiv kojih se cijepi. Zahvaljujući cijepljenju iskorijenjene su velike boginje. Eliminirana dječja paraliza, difterija, neonatalni tetanus i kongenitalna rubeola. Za druge bolesti protiv kojih se cijepi postignuto je znatno smanjenje pobola. Tako je prosječni broj oboljelih od ospica, rubeole i parotitisa zadnjih godina  za 99% niži nego u vrijeme kada je uvedeno cijepljenje.

Sanitarna i zdravstvena inspekcija Ministarstva zdravstva su ovlašteni za provedbu upravnog nadzora i donošenja kaznenih mjera.

Promjene u Programu cijepljenja, a osobito uvođenje novih cjepiva važan su javnozdravstveni događaj  za koji je važna dobra priprema, informiranje bez subjektivnih i pristranih stavova. Potreban je konsenzus stručne zajednice i politička volja. Podlogu za neuspjeh uvođenja novih cjepiva može dati pretjerano očekivanje od cijepljenja ili preuveličavanje nuspojava i komplikacija. Za individualnu zaštitu primjenjuju se cjepiva koja nisu u obveznom programu,  a cijepi se protiv pneumokoka,  varičela, gripe, protiv HPV, krpeljnog meningoencefalitisa, hepatitisa A, žute groznice, bjesnoće i slično.

Potrebna je harmonizacija sa suvremenim znanstvenim spoznajama i zalaganje da sva djeca u Hrvatskoj budu jednako i optimalno cijepljena s najkvalitetnijim cjepivima.